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Avi-tag

人阅读 发布时间:2018-04-11 08:34

Avi-tag——15个氨基酸残基组成的短肽标签

2.1 Avi-tag简介

 

Avi-tag是一个由15个氨基酸残基组成的短肽标签(图32),在体内或体外都能被生物素连接酶在赖氨酸残基连接上一个生物素,从而实现蛋白的生物素化。而抗生物素蛋白或链霉亲和素可以专一地与生物素结合,正是基于这两个反应,Avi-tag技术可以应用于蛋白的固定、纯化和显影等。借助Avi-tag和生物素连接酶,基本上所有的蛋白质都能被有效的、特异性地标记上生物素标签。在体外试验中,BirA酶标记生物素的效率超过了95%。

 

2.2 与化学方法标记生物素相比,酶催化标记生物素的优势
Avi-tag借助生物素连接酶的酶催化反应来标记生物素,相比使用化学方法给蛋白质标记生物素标签无疑具有一系列的优点:无论在体外或者体内,几乎所有的蛋白都可以在一个独特的Avi-tag位点轻易且有效地被生物素化;由于此类生物素化是通过酶和底物的反应来实现,反应条件相当温和而且标记的专一性极高。

相反,化学标记法是随机的标记,如果蛋白质的结合位点或催化位点被生物素标记,那么蛋白质就有可能丧失活性。而且使用化学方法标记的蛋白质会在链霉素表面以任意方式结合,这也会造成被标记蛋白正常构象受到破坏从而失去其功能。

此外,化学标记法还无法应用于异质蛋白样品(heterogeneous populations of protein)的标记。因为化学标记法是非特异性的标记,所以还缺乏重复性,每次试验的结果容易不一致。针对这些缺点Avi-tag系统通过特异性的生物素化技术都能很好地解决。

化学方法的生物素标签是85个氨基酸,而生物素Avi-tag只有15个氨基酸,大小是前者的五分之一,这对尽量降低标签对蛋白的空间结构的影响来讲非常重要。

 
2.3 Avi-tag的应用(图33)

Avi-Tag系统能简单、高效地纯化蛋白或固定吸附蛋白。由于Avi-tag标签非常小,所以基本上能使所有的蛋白质固定到任何介质表面,例如微量滴定板(micro-titer plate)、层析介质(chromatography media)、生物传感芯片(biosensor chip)、硝化纤维素膜(nitrocellulose)以及PVDF膜等。它可以广泛应用于医学和工业领域,并且已经在这些领域中得到了越来越多的应用:生物传感(Biosensor)、诊断(Diagnostic)、闪烁迫近分析法(Proximity assay)、药物筛选(Drug Screening)。Avi-tag标签已经被证明在如下领域是非常适用的。

(1)蛋白纯化:利用单体抗生物素来进行Avi-tag融合蛋白纯化比其它常用的标签技术,如6×His效率更高。

(2)蛋白检测:与抗生物素或链霉亲和素结合之后,Avi-tag融合蛋白就可以被多种方法检测,例如Western blot和T细胞染色。

(3)细胞分选

(4)敏感蛋白检测:固定化的Avi-tag标签融合蛋白的应用广泛,包括从高通量筛选到表面等离子体共振检测蛋白间相互作用等方面。

 

2.4 Avi-tag ORF表达克隆及其应用

广州复能基因有限公司开发的载体能在目的蛋白的N端、C端加上Avi-tag标签,高效融合表达,对Avi-tag的融合表达载体进行了优化,并构建好了人类、小鼠的编码基因ORF与Avi-tag融合表达克隆(http://www.genecopoeia.com/product/avitag/)(图34)。研究人员可选购各种Avi-tag ORF融合表达克隆,直接进行下游的研究工作。

 
由于生物素连接酶是来源于细菌等低等生物,在高等哺乳动物细胞是没有这类酶,也就无法在哺乳动物细胞内把Avi-Tag ORF融合表达克隆标记上生物素,因此哺乳动物细胞表达的Avi-Tag融合蛋白往往需要体外生物素化,这就大大限制了Avi-Tag的应用。广州复能基因有限公司结合Avi-Tag与IRES技术,建立了在高等哺乳动物细胞内进行酶促催化生物素化的体系,使得哺乳动物细胞表达的Avi-Tag融合蛋白在胞内就被生物素化(http://www.genecopoeia.com/product/ires/)(图35)。

 

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